Der FC Gerzensee wurde am 14. Dezember 1994 in der altehrwürdigen Kramburgstube im Restaurant Goldenes Kreuz Gerzensee gegründet. Insgesamt 23 Personen wohnten diesem denkwürdigen und historischen Abend bei.

Bereits in seiner Jugendzeit träumte unser Präsident Zulliger Fabian davon, dass in Gerzensee früher oder später ein eigener Fussball-Club entstehen sollte. Mangels vorhandener Infrastruktur schien dieses Vorhaben aber auf Lebzeiten nur ein Wunschtraum zu bleiben. Bis sich dann einige Jahre nach dem Sportplatzbau des Studienzentrums Gerzensee auf einmal unerwartete Möglichkeiten eröffneten.

Nach längeren Verhandlungen mit den verantwortlichen Personen des Ausbildungszentrums erhielten die FCG-Gründer im November 1994 die Bewilligung, den Sportplatz für die Durchführung der wöchentlichen Trainings und das Absolvieren der Freundschafts- und Meisterschaftsspiele benützen zu dürfen.

Damit war der Grundstein für die weiteren Vorbereitungsarbeiten endlich gelegt! Nun galt es, rund um das “Initiativkomitee FC Gerzensee“ eine breit abgestützte Unterstützung in der Bevölkerung aufzubauen um die nötige Infrastruktur realisieren zu können.

Nach unzähligen Stunden Vorbereitungszeit (Vorstandsmitgliedersuche, Ausarbeitung der Vereinsstatuten, Abklärungen für Sportplatz- und Garderobenbenützung, Verhandlungen mit Spielern, Sponsoren und Ausrüstern sowie dem Regionalen und Schweizerischen Fussballverband ging am 14. Dezember 1994 somit ein Bubentraum in Erfüllung und der FC Gerzensee wurde gegründet. 

Im Frühling 1995 wurde der Sportplatz Bächlifeld (offizielle Bezeichnung nach Vornahme des Wettbewerbs für die beste Sportplatzbenennung) dank einigen hundert Stunden Frondienst der 1. Mannschaft mit der nötigen Infrastruktur (Tore, Auffangnetze etc.) bestückt.

Nun waren die Voraussetzungen gegeben, dass der FC Gerzensee in der Saison 1995/1996 mit seiner 1. Mannschaft in der 5. Liga in die Meisterschaft starten konnte!

Mit viel Elan und Optimismus, aber ungewiss dessen, wie stark die Gegner sein würden, startete der FCG am 19. August 1995 gegen den Lokalrivalen FC Belp mit grossen Erwartungen in die erste Spielrunde. Die in der Vorbereitung bestrittenen 8 Freundschaftsspiele wurden durchwegs klar gewonnen. Auch der Start zur Meisterschaft glückte! Ein klarer 4:0 Auswärtssieg im Derby gegen den FC Belp sorgte dafür, dass sich die Mannschaft in aller Ruhe auf das erste offizielle Meisterschafts-Heimspiel gegen den FC Flamatt auf dem heimischen Bächlifeld vorbereiten konnte.

Vor einer für 5. Liga Verhältnisse einmaligen Kulisse (mehr als 250 Zuschauer) steigerte sich der FCG in einen wahren Spielrausch und fegte den FC Flamatt mit einer 20:0 Packung vom Platz! Damit war eine Freinacht im idyllischen Gerzensee vorprogrammiert! Die Mannschaft setzte ihre Erfolgsserie auch in der Folge auf eindrückliche Art und Weise fort. Am Schluss der Saison belegte der FCG den 1. Rang und stieg bereits nach dem 1. Vereinsjahr in die 4. Liga auf (16 Spiele, 15 Siege, 1 Niederlage, 98:12 Tore (+86) und 45 Punkte)!

Ein Hauptanliegen der Vereinsverantwortlichen bestand zweifellos in der Jugendförderung. Deshalb wurde bereits im ersten Vereinsjahr eine Fussballschule für alle Kinder im Juniorenalter (6 bis 17 Jahre) durchgeführt. Die Schule fand an vier Wochenenden jeweils am Samstagnachmittag statt. Insgesamt 48 Kinder (38 Knaben und 10 Mädchen) aus Gerzensee und den umliegenden Gemeinden nahmen an der Fussballschule teil. Unter fachkundiger Anleitung wurde den Teilnehmern das Fussball-ABC beigebracht.

Als Höhepunkt nahmen an einem der vier Trainingstage die YB-Spieler Bernhard Pulver und Andres Gerber teil! Die Möglichkeit, eines seiner Idole einmal hautnah erleben zu dürfen, erwies sich als ein für alle Beteiligten unvergessliches Erlebnis.

Am 30. August 1995 war es dann endlich soweit! Die Juniorenabteilung des FC Gerzensee wurde mit der Trainingsaufnahme der E-Junioren-Mannschaft ins Leben gerufen.

Bereits drei Wochen später nahmen die älteren Junioren das Training als sogenannte Trainingsgruppe in Angriff.

Die 1. Mannschaft des FCG sorgte auch in ihrer ersten Saison in der 4. Liga für Furore. Der Siegeszug blieb beinahe ungebremst und so belegte das Team am Schluss der Saison den hervorragenden 2. Rang und stieg mit 47 Punkten aus 20 Spielen in die 3. Liga auf!

Der FCG konnte die Klassenzugehörigkeit in den darauffolgenden Meisterschaften halten und etablierte sich als bestandene Mannschaft in der 3. Liga.

Für die Teilnahme am Meisterschaftsbetrieb der Saison 1997/98 schickte der FCG eine weitere Juniorenmannschaft bei den C-Junioren ins Rennen. 

Mit dem Start zur Saison 1998/99 erfolgte ein weiterer Meilenstein in der Geschichte des FC Gerzensee. Die neu gegründeten Mannschaften der 2. Mannschaft (5. Liga) und der D-Junioren nahmen erstmals am Meisterschaftsbetrieb teil.  

Das erste Junioren-Trainingslager führte der FCG für die E – C-Junioren am Wochenende vom 07./08. August 1999 an der Lenk durch.

Bedingt durch die bevorstehende Aufteilung der 3. Liga in zwei Stärkeklassen musste die 1. Mannschaft in der Saison 2000/2001 einen Rang unter den ersten 6 Mannschaften erreichen um in der nächsten Saison in der höheren Spielklasse (3. Liga, 1. Stärkeklasse) spielen zu können. Nachdem die Mannschaft nach der Vorrunde noch in der 2. Tabellenhälfte klassiert war, startete sie in der Rückrunde zur Aufholjagd und leitete mit dem fulminanten 11:0 Auswärtssieg im 1. Spiel der Rückrunde gegen die AS Tricolore eine unvergessliche und beeindruckende Erfolgsserie ein. Die Mannschaft spielte in der Rückrunde so erfolgreich, dass sich vor dem letzten Meisterschaftsspiel gegen den FC Rubigen die Gelegenheit bot, mit einem Sieg, aus eigener Kraft die Aufstiegsspiele zu erreichen! Leider konnte der krönende Abschluss einer hervorragenden Rückrunde nicht ganz erreicht werden und das Spiel gegen den FC Rubigen ging mit 0:2 Toren verloren! Das Ziel einen Platz in der 1. Tabellenhälfte und den damit verbundenen „Aufstieg“ in die 1. Stärkeklasse zu erreichen, konnte aber aufgrund der starken Leistungen klar erreicht werden.

Um den Junioren eine möglichst optimale Ausgangslage bieten zu können, entschieden sich die beiden Vereine FC Gerzensee und der SV Kaufdorf vor der Saison 2002/2003 in Zukunft im Juniorenbereich zusammenzuarbeiten.

Im Sommer 2002 wurden die Bauarbeiten für das neue FCG-Clublokal in Angriff genommen. Der FCG konnte sein neues „Zuhause“ im Stockwerkeigentum erwerben und beteiligte sich mit einigen hundert Frondienststunden an der Erstellung des Lokals. Am 22. März 2003 erfolgte die Eröffnung des Clublokals anlässlich des 1. Meisterschaftsspiels der Rückrunde gegen den FC Prishtina. Die Einweihung des  neuen Lokals erfolgte auf dem Bächlifeld in Gerzensee anlässlich dem Gerzensee-Fest vom 20. – 22. Juni 2003 mit dem Freundschaftsspiel der beiden Super League-Teams des BSC Young Boys und dem FC Thun (2:1).

Der FCG gewinnt am Wettbewerb "Sportrauchfrei". Der Präsident durfte am 19.08.2004 im Rail Park in Zürich einen Check von Fr. 1'000.-- in Empfang nehmen!

Grosse Ehre. Der FC Gerzensee war am 1. Heimspiel des FC Thun in der Champions League live auf dem Platz vertreten! Die alte Spielerbank, in welcher sonst am Wochenende die Ersatzspieler und Betreuer des FCG sassen, stand am Abend des 27.09.2005 im CL-Spiel

FC Thun – Sparta Prag zwischen den beiden Spielerbänken im Stade de Suisse für den

4. Schiedsrichter im Einsatz.

Ein grosses Anliegen des FC Gerzensee ist es den eigenen Nachwuchs zu fördern. Sogar die kleinsten unserer Junioren soll eine Möglichkeit geboten werden beim FCG Fussball zu spielen. Somit nahm im Frühling 2006 erstmals die Bambini Fussballschule ihren Spielbetrieb auf.

Im selben Jahr wechselte unser langjähriger Junior Manuel Bregy in die erste Mannschaft des FC Münsingen und avancierte im seinem ersten Jahr gleich zum Stammspieler in der 1. Liga!

Nachdem der FC Gerzensee in den vergangenen Jahren stets auf der Erfolgswelle reiten durfte, folgte in der Saison 2006/2007 der erste sportliche Rückschlag. Die erste Mannschaft stieg aus der 3. Liga 1. Stärkeklasse in die 3. Liga 2. Stärkeklasse ab.

Das Engagement in der Jugendförderung bewährt sich. Unser Verein gewann den Challenge Preis 2007 für die innovativste Juniorenarbeit im Kanton Bern, Wallis und Freiburg. Ausgezeichnet wird der Verein, der mit aussergewöhlichen Projekten Kinder und Jugendliche motivieren Sport zu treiben. Oberstes Ziel sind nicht Spitzenresultate, sondern Freude an der Bewegung, Teamgeist und Kameradschaft. Als Anerkennung gewann der FCG einen Barbetrag von Fr. 5'000.00. Die offizielle Preisübergabe mit Beteiligung von Grössen aus Sport, Politik und Wirtschaft erfolgte im Herbst 2007. Und es sollte noch besser kommen. Kurze Zeit später erkur die nationale Jury – dazu gehörten u.a. ex-Nati-Trainer Köbi Kuhn, die ex-Skirennfahrerin Vreni Schneider und der FIFA Schiedsrichter Urs Meier – den FC Gerzensee als landesweiten Sieger für das beste Juniorenprojekt der Schweiz. Dies wurde mit weiteren Fr. 10’0000.00 honoriert.

Im 2008 trat der Gründungsvater des FC Gerzensee, Zulliger Fabian, nach 14 Jahren als Vereinsvorsitzender zurück. An der Vereinsversammlung wurde der bisherige Vize-Präsident Sandro Wegmüller zum neuen Präsident gewählt. Die Versammlung ernannte den abtretenden Zulliger zum Ehrenpräsidenten.

Erstmals in der Geschichte des FCG nahm die Grösse des Vereins Dimensionen an, welche sich mit den vorhandenen Platzgegebenheiten kaum mehr zu bewältigen liessen. Die Nachfrage beim FCG sein Hobby auszuüben wuchs weiterhin stetig an und eine Wende des Trends lag nicht in Sicht. Die Teams trainierten zum Teil in den umliegenden Gemeinden Kirchdorf, Wichtrach, Kiesen, Münsingen und Kaufdorf. Der Verein sah sich erstmals damit konfrontiert zukünftig Junioren auf eine Warteliste zu setzen. Da dies nicht der Vereinsphilosophie entspricht, musste eine Lösung in der Frage der Infrastruktur gefunden werden. Dazu wurde eine Arbeitsgruppe bestehend aus Vertretern des FCG, dem Turnverein Gerzensee, der Gemeinde, der Schule und des Studienzentrums eingesetzt, um ein Konzept für eine neue Freiluftsportanlage zu erarbeiten.

Ein Meilenstein des FC Gerzensee ereignete sich am 6. Dezember 2008 als die Bevölkerung an der Gemeindeversammlung mit grossem Mehr einer Erstellung der neuen Freiluftsportanlage zustimmte. Dieses umfasste schlussendlich den Bau eines neuen Kunstrasenspielfelds als - Haupt- und Trainingsplatz - und eine 100 Meter Laufbahn mit integrierter Weitsprunganlage. Der Klub verpflichtete sich mit einen einmaligen Betrag von Fr. 175'000.00 (100'000.00 sofort, 75'000.00 während den nächsten 6 Jahren) an den Entstehungskosten von total Fr.1'400'000.00 zu beteiligen. Der Spatenstich erfolgte am 2. Juni 2009.

Im Sommer 2009 konnte die neue Anlage in Betrieb genommen werden und während dem Wochenende des 4., 5., 6. September 2009 fand in Gerzensee ein 3-tägiges Einweihungsfest statt.

In die Saison 2009/2010 startete der FC Gerzensee mit folgenden 11 Mannschaften:

Aktive

1. Mannschaft (3. Liga, 2. Stärkeklasse)
2. Mannschaft (5. Liga)
Senioren

Junioren

B-Junioren (1. Stärkeklasse)
C-Junioren (2. Stärkeklasse)
D-Junioren (Team A + B KIFU (9-er Fussball))
E-Junioren (Team A + B KIFU (7-er Fussball))
F-Junioren (KIFU (5-er Fussball))
Bambini Fussballschule